234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3495 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  100 
 
 		 495 aa  985    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  52 
 
 		 545 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.45 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0113749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1295  lipase/acylhydrolase, putative  34.36 
 
 		 390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.336383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  35.2 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  58.56 
 
 		 743 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  58.77 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  49.21 
 
 		 488 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0912  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.38 
 
 		 366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.273013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  50.38 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  55.56 
 
 		 605 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  54.78 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  35.24 
 
 		 814 aa  128  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  51.89 
 
 		 469 aa  123  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3337  acetylxylan esterase  30.17 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00939156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  50.82 
 
 		 785 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  37.87 
 
 		 767 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  41.54 
 
 		 455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  44.09 
 
 		 1128 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  54.13 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  56.31 
 
 		 774 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  46.21 
 
 		 681 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  46.32 
 
 		 669 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  47.75 
 
 		 846 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  47.41 
 
 		 633 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.25 
 
 		 984 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.88 
 
 		 979 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  40.77 
 
 		 854 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  49.06 
 
 		 744 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.99 
 
 		 590 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  52.08 
 
 		 485 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  51.4 
 
 		 746 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  48.54 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  50 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  49.02 
 
 		 913 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  40.97 
 
 		 963 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  41.26 
 
 		 842 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  47.57 
 
 		 596 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  34.96 
 
 		 609 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  39.86 
 
 		 589 aa  100  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  44.66 
 
 		 628 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  43.8 
 
 		 974 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  37.93 
 
 		 812 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  45.71 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  40.48 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  47.17 
 
 		 420 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  45.45 
 
 		 875 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  49.5 
 
 		 393 aa  95.1  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  39.34 
 
 		 966 aa  94.7  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2370  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  28 
 
 		 360 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00713619  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  35.88 
 
 		 773 aa  93.6  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  53.15 
 
 		 829 aa  93.6  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  44.76 
 
 		 934 aa  93.2  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  47.62 
 
 		 775 aa  91.3  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  44.12 
 
 		 688 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  41.67 
 
 		 847 aa  90.5  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  35.88 
 
 		 371 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  43.93 
 
 		 864 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  46.32 
 
 		 1055 aa  88.6  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  43.14 
 
 		 778 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  41.88 
 
 		 942 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  48.04 
 
 		 489 aa  87.8  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  42.16 
 
 		 518 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  43.56 
 
 		 580 aa  87.4  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  44.12 
 
 		 494 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  39.26 
 
 		 620 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  38.84 
 
 		 525 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  44.12 
 
 		 681 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  42.16 
 
 		 925 aa  86.7  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  45.22 
 
 		 366 aa  86.7  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  39.22 
 
 		 894 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  44.23 
 
 		 990 aa  86.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  42.15 
 
 		 694 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  45.16 
 
 		 593 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  39.81 
 
 		 611 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  46 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  42.57 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  47.83 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  40.57 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  41.18 
 
 		 623 aa  84.3  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  43.56 
 
 		 880 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  39.84 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  44.55 
 
 		 906 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  45.1 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  43.56 
 
 		 543 aa  83.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  46.08 
 
 		 935 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  38.6 
 
 		 1042 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  40 
 
 		 727 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.64 
 
 		 998 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  49.4 
 
 		 673 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40.38 
 
 		 743 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  41.18 
 
 		 842 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  43.81 
 
 		 763 aa  81.3  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  47.78 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  42.48 
 
 		 794 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  43.69 
 
 		 646 aa  80.9  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  41.82 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  43.33 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  41.58 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>