More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1418 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 
1181 aa  2368    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.97 
 
 
1187 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  30.08 
 
 
1188 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  30.08 
 
 
1188 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  30.82 
 
 
1189 aa  486  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 
1186 aa  483  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.1 
 
 
1190 aa  478  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29.48 
 
 
1189 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.48 
 
 
1196 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  29.16 
 
 
1185 aa  467  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  29.14 
 
 
1189 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  29.59 
 
 
1189 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  29.18 
 
 
1189 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 
1191 aa  459  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 
1190 aa  458  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  31.1 
 
 
1187 aa  459  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  31.31 
 
 
1191 aa  458  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  30.44 
 
 
1186 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.93 
 
 
1189 aa  452  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  29.01 
 
 
1189 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.93 
 
 
1189 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.89 
 
 
1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.81 
 
 
1189 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.89 
 
 
1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.97 
 
 
1189 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 
1177 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  29.15 
 
 
1185 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  29.89 
 
 
1177 aa  439  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  29.49 
 
 
1199 aa  436  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  29.53 
 
 
1199 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  29.57 
 
 
1199 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 
1198 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  29.1 
 
 
1184 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  29.32 
 
 
1174 aa  425  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  30.23 
 
 
1179 aa  421  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  28.92 
 
 
1187 aa  412  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  29.53 
 
 
1177 aa  413  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  28.58 
 
 
1176 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.27 
 
 
1204 aa  383  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.18 
 
 
1187 aa  380  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  28.27 
 
 
1176 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  28.61 
 
 
1175 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  28.59 
 
 
1176 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  27.96 
 
 
1176 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  26.7 
 
 
1175 aa  369  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  27.49 
 
 
1170 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.95 
 
 
1164 aa  366  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  28.55 
 
 
1176 aa  365  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.53 
 
 
1170 aa  364  5.0000000000000005e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  27.24 
 
 
1180 aa  360  7e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  28.28 
 
 
1134 aa  354  4e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  26.85 
 
 
1148 aa  351  5e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  26.85 
 
 
1178 aa  350  8e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  27.6 
 
 
1186 aa  350  8e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  27.71 
 
 
1185 aa  348  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 
1179 aa  347  5e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.92 
 
 
1185 aa  346  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  27 
 
 
1153 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  26.68 
 
 
1177 aa  337  7e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  26.65 
 
 
1171 aa  323  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  26.46 
 
 
1168 aa  323  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  27.14 
 
 
1179 aa  320  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  25.58 
 
 
1301 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  27.11 
 
 
1167 aa  316  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  26.7 
 
 
1167 aa  315  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  26.49 
 
 
1167 aa  315  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  26.29 
 
 
1167 aa  314  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  26.28 
 
 
1163 aa  311  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.85 
 
 
1174 aa  307  9.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  26.15 
 
 
1171 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  24.29 
 
 
1176 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  27.01 
 
 
1172 aa  303  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 
1188 aa  298  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1189 aa  291  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  25.2 
 
 
1189 aa  291  4e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  24.22 
 
 
1184 aa  290  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.76 
 
 
1171 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  32.57 
 
 
1189 aa  287  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 
1190 aa  284  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  31.89 
 
 
1185 aa  283  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  26.23 
 
 
1403 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 
1191 aa  281  7e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  25.16 
 
 
1189 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  26.15 
 
 
1146 aa  272  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  25.54 
 
 
1146 aa  269  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  24.16 
 
 
1189 aa  268  4e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.1 
 
 
1175 aa  268  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  24.42 
 
 
1193 aa  268  5.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25.14 
 
 
1189 aa  266  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  27.62 
 
 
1185 aa  265  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.92 
 
 
1174 aa  262  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  27.76 
 
 
1185 aa  261  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  25.92 
 
 
1146 aa  258  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  26.33 
 
 
1191 aa  247  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  48.96 
 
 
1192 aa  245  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  25.72 
 
 
1082 aa  244  9e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  25.4 
 
 
1215 aa  241  6.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  24.13 
 
 
1308 aa  240  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  24.96 
 
 
1209 aa  238  7e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  40.54 
 
 
1200 aa  237  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>