More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0819 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0842  diguanylate cyclase with extracellular sensor  97.63 
 
 		 484 aa  951    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.105968  hitchhiker  0.00226884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0819  diguanylate cyclase  100 
 
 		 507 aa  1059    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00531525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0854  diguanylate cyclase  98.82 
 
 		 507 aa  1047    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0841  GGDEF domain-containing protein  71.13 
 
 		 489 aa  728    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3519  extracellular solute-binding protein  95.79 
 
 		 366 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  72.09 
 
 		 482 aa  726    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  71.88 
 
 		 482 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  73.61 
 
 		 483 aa  717    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0549  diguanylate cyclase  53.75 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0215358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3516  diguanylate cyclase  93.75 
 
 		 160 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.013928  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2959  GGDEF domain-containing protein  50.35 
 
 		 292 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000656128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02407  GGDEF domain protein  32.96 
 
 		 503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 458 aa  259  6e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  30.47 
 
 		 714 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  31.61 
 
 		 474 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  31.36 
 
 		 794 aa  244  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  31.52 
 
 		 464 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  30.11 
 
 		 935 aa  238  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  29.37 
 
 		 778 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2961  GGDEF domain-containing protein  54.44 
 
 		 204 aa  213  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0857681  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  26.2 
 
 		 775 aa  207  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  28.54 
 
 		 712 aa  199  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2185  diguanylate cyclase  29.61 
 
 		 941 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.260855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 589 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  28.45 
 
 		 923 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 955 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1844  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 932 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1934  diguanylate cyclase  30.25 
 
 		 937 aa  163  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0766434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2039  diguanylate cyclase with extracellular sensor  29.29 
 
 		 912 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0269682  hitchhiker  0.000000244551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2037  diguanylate cyclase  28.83 
 
 		 928 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2424  diguanylate cyclase  28.83 
 
 		 928 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00236557  normal  0.130217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2308  diguanylate cyclase  28.44 
 
 		 928 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00466975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1952  diguanylate cyclase  28.28 
 
 		 937 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.105215  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2434  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 937 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2029  diguanylate cyclase  27.75 
 
 		 932 aa  153  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0571217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1897  diguanylate cyclase  27.82 
 
 		 937 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0415273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2081  diguanylate cyclase  27.59 
 
 		 937 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0379355  normal  0.0338945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 1251 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  28.62 
 
 		 1065 aa  145  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  42.48 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0836  diguanylate cyclase  32.55 
 
 		 487 aa  136  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.975884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2576  diguanylate cyclase  26.48 
 
 		 931 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000375627  hitchhiker  0.0011212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3700  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.25 
 
 		 772 aa  135  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  39.23 
 
 		 332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  35.15 
 
 		 738 aa  134  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  36.8 
 
 		 753 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.9 
 
 		 768 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3649  GGDEF family protein  35.22 
 
 		 456 aa  133  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  29.17 
 
 		 893 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  39.27 
 
 		 548 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.76 
 
 		 669 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0489  GGDEF family protein  27.96 
 
 		 469 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.788627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.53 
 
 		 765 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3427  putative diguanylate cyclase (GGDEF)  35.71 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1888  GGDEF domain-containing protein  28.01 
 
 		 930 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000133848  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1232  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.35 
 
 		 416 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 580 aa  128  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1271  putative response regulator  35.29 
 
 		 443 aa  128  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3550  diguanylate cyclase  40 
 
 		 559 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953301  normal  0.354246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 591 aa  127  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 438 aa  126  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  40.98 
 
 		 628 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 1574 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04420  hypothetical protein  38.38 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1759  GGDEF domain-containing protein  41.49 
 
 		 355 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2588  response regulator receiver protein  41.24 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 626 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  40.11 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.77 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137039  normal  0.392599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  43.37 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2394  GGDEF domain-containing protein  37.99 
 
 		 415 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 302 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  36.56 
 
 		 556 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  37.43 
 
 		 565 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  38.32 
 
 		 493 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  25.74 
 
 		 934 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.26 
 
 		 1078 aa  124  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1844  diguanylate cyclase  35.05 
 
 		 456 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.674113  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  37.38 
 
 		 1526 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 227 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  34.85 
 
 		 340 aa  123  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0615  diguanylate cyclase  40.78 
 
 		 320 aa  123  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000794548 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  38.51 
 
 		 420 aa  123  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  37.72 
 
 		 493 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1387  diguanylate cyclase  29.93 
 
 		 336 aa  123  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.617999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  34.76 
 
 		 432 aa  123  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5901  diguanylate cyclase  35.63 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0220  diguanylate cyclase  34.78 
 
 		 539 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.454807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2179  diguanylate cyclase  40 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000210421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2896  cellulose binding, type IV  32.16 
 
 		 443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  37 
 
 		 949 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1934  hypothetical protein  37.97 
 
 		 634 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  35.12 
 
 		 659 aa  121  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.31 
 
 		 610 aa  121  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00151  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  37.79 
 
 		 353 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  34.95 
 
 		 629 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1369  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.84 
 
 		 302 aa  121  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>