278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2449 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  69.38 
 
 
503 aa  713    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
537 aa  1085    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  45.76 
 
 
510 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  42.66 
 
 
699 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  79.31 
 
 
582 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  39.51 
 
 
341 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  39.44 
 
 
357 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  61.27 
 
 
566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.87 
 
 
341 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  36.79 
 
 
331 aa  140  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  38.1 
 
 
319 aa  140  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.45 
 
 
327 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.42 
 
 
352 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  34.26 
 
 
315 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.48 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.4 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  29.68 
 
 
829 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.51 
 
 
357 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.87 
 
 
355 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.87 
 
 
356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.96 
 
 
343 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  32.7 
 
 
472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  30.06 
 
 
345 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  37.59 
 
 
598 aa  125  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  47.48 
 
 
411 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  26.43 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  34.62 
 
 
491 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  33.02 
 
 
337 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.1 
 
 
472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  42.36 
 
 
1413 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  42.76 
 
 
789 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  29.02 
 
 
501 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  30.17 
 
 
522 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.76 
 
 
366 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.9 
 
 
379 aa  108  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.24 
 
 
334 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  41.18 
 
 
412 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  43.61 
 
 
897 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.3 
 
 
507 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  40.97 
 
 
691 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  30.46 
 
 
524 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.88 
 
 
507 aa  97.1  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 
345 aa  95.1  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.77 
 
 
495 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  37.5 
 
 
672 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  31.53 
 
 
304 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  41.01 
 
 
1139 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  38.97 
 
 
963 aa  94  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.04 
 
 
466 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.55 
 
 
507 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.97 
 
 
520 aa  92.8  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 
636 aa  93.2  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  38.41 
 
 
494 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.31 
 
 
474 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  37.67 
 
 
563 aa  90.9  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  35.06 
 
 
1259 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  30.03 
 
 
320 aa  90.9  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36.76 
 
 
491 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 
512 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  39.71 
 
 
771 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  41.67 
 
 
436 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  26.59 
 
 
456 aa  87.8  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  38.52 
 
 
430 aa  87.4  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  38.41 
 
 
495 aa  87  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  32.68 
 
 
571 aa  87  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  37.23 
 
 
401 aa  86.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  30 
 
 
306 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.17 
 
 
472 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  34.33 
 
 
737 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.04 
 
 
497 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.78 
 
 
514 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  37.86 
 
 
560 aa  84  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  35.48 
 
 
576 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.35 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.75 
 
 
695 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
572 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.85 
 
 
707 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.43 
 
 
476 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 
340 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  26.93 
 
 
804 aa  78.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.13 
 
 
810 aa  77.4  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 
560 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  36.5 
 
 
943 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  36.43 
 
 
615 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  26.58 
 
 
1112 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  28.16 
 
 
519 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  24.07 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  37.5 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  28.34 
 
 
494 aa  75.1  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.63 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  24.48 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  27.06 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  33.33 
 
 
863 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  32.59 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  25.13 
 
 
703 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.25 
 
 
562 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  29.93 
 
 
664 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  25.82 
 
 
746 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  30.66 
 
 
957 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  24.21 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>