100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3969 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  828    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 417 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 		 410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 410 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  37.78 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  35.5 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  36.59 
 
 		 402 aa  176  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 442 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 408 aa  130  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  33.24 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  31.98 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  34 
 
 		 387 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 433 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 409 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  31.94 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  29.47 
 
 		 416 aa  110  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 397 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  30.9 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 393 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  31.44 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.32 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  25.96 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  33.15 
 
 		 216 aa  67  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  21.09 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  25.68 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 414 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  28.03 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  25.44 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  19.73 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1540  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 397 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  28.12 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>