221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2258 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
421 aa  769    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 
391 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  29.5 
 
 
410 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  33.2 
 
 
426 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  34.5 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.89 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  36.27 
 
 
387 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  26.83 
 
 
425 aa  90.1  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  25.89 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  27.37 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
402 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  31.5 
 
 
389 aa  87  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  29.81 
 
 
410 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.18 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  32.94 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  34.82 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  35.4 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  35.4 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.07 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  29.45 
 
 
403 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  32.55 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.52 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  35.77 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  27.42 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  27.35 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  27.35 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  27.27 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  30.59 
 
 
432 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  25.93 
 
 
400 aa  77  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  32.5 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  41.29 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  32.75 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.92 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  29.92 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  32.7 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  26.14 
 
 
402 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
433 aa  67  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  39.35 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  25.84 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  25.81 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  26.52 
 
 
416 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  25.65 
 
 
407 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  30.88 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 
404 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  29.58 
 
 
216 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  29.21 
 
 
415 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
411 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  28.1 
 
 
442 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
422 aa  63.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  30.06 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  25.84 
 
 
417 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
408 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  24.42 
 
 
412 aa  60.1  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
414 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  29.02 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  25.49 
 
 
425 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 
400 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  25.61 
 
 
430 aa  60.1  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  26.2 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  25.26 
 
 
413 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.44 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  28.4 
 
 
406 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
433 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
407 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  34.39 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
405 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  25.06 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  28.05 
 
 
369 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  23.32 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  27.43 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  31.41 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  25.77 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  24.46 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
402 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  25.58 
 
 
420 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  27.27 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
391 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  31.28 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
433 aa  53.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  27.98 
 
 
393 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.43 
 
 
428 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
483 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  25.26 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>