89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4892 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  774    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  50.26 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  51.66 
 
 		 411 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 410 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 410 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  34.99 
 
 		 395 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  32.96 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  34.34 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  36.26 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  33.71 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 397 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  29.19 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 403 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 394 aa  99.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  31.23 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 409 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 416 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 404 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  25.93 
 
 		 402 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  24.49 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.43 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.26 
 
 		 461 aa  47.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  27.63 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.07 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 548 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  28.21 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 		 517 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  21.63 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 482 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0869  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 487 aa  43.5  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  27.38 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>