70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0643 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  766    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  66.75 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 396 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  48.14 
 
 		 385 aa  225  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  38.07 
 
 		 414 aa  212  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 399 aa  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  30 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  31.46 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  31.04 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 399 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 417 aa  93.2  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  29.63 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  27.12 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  30.3 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  26.32 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  29.13 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  29.46 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  33.13 
 
 		 216 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1848  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>