156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4495 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 409 aa  758    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  66.58 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  50.41 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  50.41 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  50.96 
 
 		 401 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  50.27 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  53.39 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 442 aa  140  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  33.88 
 
 		 415 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 387 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 432 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  32.75 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  34.46 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  42.42 
 
 		 216 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 408 aa  94.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  21.75 
 
 		 397 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 404 aa  94  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 369 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 397 aa  86.3  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  37.58 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  33.21 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  33.24 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  32.6 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  23.47 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  23.66 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  37.21 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 486 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  33.2 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  27.35 
 
 		 184 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  24.28 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 455 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  24.93 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.64 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  28 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  25 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.49 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  18.37 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.21 
 
 		 410 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  25.83 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  21.28 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  21.28 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>