191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5421 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 433 aa  825    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  76.54 
 
 		 414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  49.51 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  49.48 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  34 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 410 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 416 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 408 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  34 
 
 		 416 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  34 
 
 		 416 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 417 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  35.46 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  30.37 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  29.8 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  30.03 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  31.83 
 
 		 416 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 389 aa  108  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  28.65 
 
 		 395 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  28.77 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 387 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 387 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 393 aa  89.7  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  34.71 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  33.53 
 
 		 397 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  27 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  23.81 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  24.15 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  23.06 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  31 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  25.6 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  24.69 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  26.52 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  24.26 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  29.69 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>