88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1334 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 402 aa  777    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  77.86 
 
 		 402 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  77.11 
 
 		 402 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 		 426 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 387 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  38.59 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 399 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 408 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 410 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 369 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  38.1 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  33.43 
 
 		 416 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  36.81 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  33.87 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  33.07 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 408 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 397 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  30.17 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  33.24 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  30.42 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  32.82 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 442 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  31 
 
 		 385 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  28.41 
 
 		 415 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  31.16 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.55 
 
 		 434 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 408 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1791  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0460445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5076  major facilitator superfamily permease protein  24.92 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>