154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4599 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  98 
 
 
416 aa  740    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  98 
 
 
416 aa  740    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  100 
 
 
401 aa  760    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  72.6 
 
 
395 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 
416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  49.86 
 
 
405 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  53.83 
 
 
419 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  44.97 
 
 
403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  50.28 
 
 
409 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 
404 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 
408 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  34.72 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 
415 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  36.36 
 
 
442 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  33.78 
 
 
408 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  33.17 
 
 
416 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  34.37 
 
 
414 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  32.17 
 
 
417 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  33.25 
 
 
425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
433 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  34.17 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  33.89 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  34.66 
 
 
402 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  33.77 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  35.51 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  33.61 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  32.5 
 
 
432 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  37.11 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
414 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  32.62 
 
 
387 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
426 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 
391 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  33.24 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  33.43 
 
 
408 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  32.88 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  31.3 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  34.09 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  30.67 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  33.42 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
399 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  30.64 
 
 
395 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  31.67 
 
 
399 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  33.14 
 
 
387 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  27.54 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  30.81 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  32.77 
 
 
386 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 
400 aa  96.3  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
408 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  33.2 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
400 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  30.34 
 
 
397 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  37.43 
 
 
216 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.91 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.93 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  31.61 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  27.17 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  27.09 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  26.65 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
402 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  30.48 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  29.95 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 
430 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  24.47 
 
 
412 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  29.95 
 
 
411 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  29.95 
 
 
411 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 
396 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  29.18 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  27.08 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
404 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 
408 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
437 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.51 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.35 
 
 
409 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  31.79 
 
 
397 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  26.1 
 
 
405 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.94 
 
 
434 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  26.11 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03970  transporter, putative  27.13 
 
 
539 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  24.46 
 
 
420 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  27.37 
 
 
442 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.99 
 
 
408 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  25.73 
 
 
405 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 
405 aa  53.5  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  23.64 
 
 
427 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.8 
 
 
414 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  23.73 
 
 
438 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>