More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1789 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  100 
 
 		 400 aa  774    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  76 
 
 		 404 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  77 
 
 		 404 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  63.59 
 
 		 413 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  56.86 
 
 		 410 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  58.08 
 
 		 402 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  58.85 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  58.02 
 
 		 409 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  58.31 
 
 		 408 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  58.75 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  59.45 
 
 		 411 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  59.45 
 
 		 411 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  55.84 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  51.26 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 414 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  34.19 
 
 		 409 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 419 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 430 aa  143  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  31.51 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  30.37 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 420 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 417 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 415 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  28.27 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 439 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 411 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 411 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  25.95 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 418 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 421 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 421 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.3 
 
 		 430 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.19 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 421 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  29.3 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.55 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  25.7 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  26.6 
 
 		 506 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 431 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 432 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 405 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 405 aa  96.7  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 432 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 432 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.83 
 
 		 410 aa  96.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.73 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.92 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 452 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.12 
 
 		 452 aa  93.2  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  24 
 
 		 408 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  28.53 
 
 		 415 aa  92.8  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 434 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  23.88 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  23.28 
 
 		 413 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  24.81 
 
 		 401 aa  91.3  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  25.89 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  25.88 
 
 		 421 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>