More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3546 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  95.36 
 
 		 431 aa  777    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 431 aa  849    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  86.01 
 
 		 430 aa  723    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  67.92 
 
 		 435 aa  542  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  68.92 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  60.48 
 
 		 430 aa  519  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  63.93 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  63.57 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  60.24 
 
 		 429 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  63.95 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  62.78 
 
 		 457 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  64.49 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  58.33 
 
 		 435 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  58.28 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  59.06 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  54.17 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  58.37 
 
 		 427 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  52.88 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  49.65 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  50.96 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  49.06 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  49.52 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  48.1 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  48.07 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  47.16 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  46.92 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  48.12 
 
 		 427 aa  372  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 427 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  48.07 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  47.83 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  47.58 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 418 aa  353  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  51.24 
 
 		 432 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 		 405 aa  339  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 442 aa  328  8e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 431 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  46.55 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 		 438 aa  320  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 		 409 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 422 aa  280  3e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 424 aa  279  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.9 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  27.21 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.2 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  26.74 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  26.55 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 402 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 405 aa  120  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  27.62 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 417 aa  116  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  29.21 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 409 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  28.72 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 410 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  26.17 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>