More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6107 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  91.95 
 
 		 408 aa  690    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  98.54 
 
 		 411 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  795    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  83.41 
 
 		 410 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  86.8 
 
 		 409 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  88.45 
 
 		 405 aa  654    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  795    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  73.13 
 
 		 402 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  71.03 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  67.9 
 
 		 402 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  59.9 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  57.47 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  55.78 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  56.78 
 
 		 404 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  30.05 
 
 		 412 aa  136  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 416 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 414 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.86 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  30.1 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  23.47 
 
 		 412 aa  93.6  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 452 aa  93.2  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  26.67 
 
 		 528 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  27.24 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  29.33 
 
 		 425 aa  89.7  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 422 aa  90.1  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.88 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  28.39 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 421 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 436 aa  86.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.3 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 434 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.62 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  26.23 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  26.43 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  26.42 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  26.9 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  23.45 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>