More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5540 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  780    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  47.89 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 420 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  36.27 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 424 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.42 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 402 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 442 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 421 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  25.25 
 
 		 487 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 429 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 430 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 407 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 		 450 aa  86.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.15 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 431 aa  86.7  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 418 aa  86.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 421 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  23.93 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03997  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03240)  26.01 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00242974  normal  0.101334 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  25.68 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32560  Monocarboxylate transporter  22.92 
 
 		 512 aa  83.2  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  26.14 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  24.05 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.2 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03722  MFS monocarboxylate transporter (Mct), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17360)  26.7 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  24.56 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  23.36 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  23.36 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08366  conserved hypothetical protein  24.66 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  23.93 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 409 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  26.61 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  23.69 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  24.44 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  23.65 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  23.93 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  24.76 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10410  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05660)  26.63 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  23.41 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  27.01 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  23.36 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  23.32 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>