111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32560 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_32560  Monocarboxylate transporter  100 
 
 		 512 aa  1047    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66842  Monocarboxylate transporter  41.35 
 
 		 523 aa  361  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.756809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_4422  Monocarboxylate transporter  47.71 
 
 		 410 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  31.76 
 
 		 606 aa  216  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03658  MFS transporter (Mch2), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12260)  26.73 
 
 		 485 aa  206  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0976864  normal  0.916138 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08507  conserved hypothetical protein  28.37 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000272571  normal  0.0467557 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  25.61 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08366  conserved hypothetical protein  27.42 
 
 		 443 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  24.65 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00528  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03722  MFS monocarboxylate transporter (Mct), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17360)  25.54 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  25.05 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  25.88 
 
 		 421 aa  92.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07898  conserved hypothetical protein  24.02 
 
 		 444 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189229 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00382  conserved hypothetical protein  23.86 
 
 		 431 aa  90.5  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483228  normal  0.39904 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 		 448 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02430  transporter, putative  25.26 
 
 		 453 aa  87.4  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03997  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03240)  24.71 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00242974  normal  0.101334 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08995  conserved hypothetical protein  25.51 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.343646  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08934  conserved hypothetical protein  22.83 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279116  normal  0.171423 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  25.81 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10410  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05660)  23.78 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  25.67 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  23.33 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  22.93 
 
 		 439 aa  79.7  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11092  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00780)  23.38 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04160  transporter, putative  27.76 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33613  Monocarboxylate transporter  23.92 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  21.85 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03970  transporter, putative  23.2 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09333  Monocarboxylate transporter (Eurofung)  24.56 
 
 		 1072 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143082  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02840  Monocarboxylate transporter-like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I2]  25.23 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00450414 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  23.14 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  23.02 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04810  transporter, putative  25.99 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 426 aa  57  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  22.18 
 
 		 398 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  22.18 
 
 		 398 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  22.18 
 
 		 398 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30340  monocarboxylate permease homolog  23.47 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.22847  normal  0.486952 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  22.18 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  22.18 
 
 		 398 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 		 429 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  21.72 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00830  monocarboxylic acid transporter, putative  26.27 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  20.44 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  21.22 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  21.22 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  22.45 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 520 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  22.45 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 		 520 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 400 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04790  transporter, putative  22.48 
 
 		 449 aa  51.6  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.33 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  20.44 
 
 		 443 aa  51.2  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 520 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  21.72 
 
 		 402 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  21.72 
 
 		 402 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  22.07 
 
 		 402 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 520 aa  50.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  23.86 
 
 		 413 aa  50.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  21.72 
 
 		 402 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.78 
 
 		 520 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 520 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04800  monocarboxylic acid transporter, putative  23.94 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 520 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 393 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  21.38 
 
 		 402 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  21.38 
 
 		 402 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04780  transporter, putative  22.16 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1875  multidrug resistance protein B  27.78 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.84 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.22 
 
 		 520 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 400 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 400 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 414 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.5 
 
 		 520 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 520 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 520 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 430 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 520 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 441 aa  47  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>