More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4486 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.04 
 
 		 520 aa  878    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.42 
 
 		 520 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.29 
 
 		 520 aa  872    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.42 
 
 		 520 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.38 
 
 		 520 aa  888    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  100 
 
 		 520 aa  1044    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.04 
 
 		 520 aa  878    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.23 
 
 		 520 aa  880    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85 
 
 		 520 aa  881    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  96.62 
 
 		 520 aa  984    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.19 
 
 		 520 aa  882    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.69 
 
 		 520 aa  880    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.38 
 
 		 520 aa  884    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  86.08 
 
 		 520 aa  881    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1875  multidrug resistance protein B  88.02 
 
 		 360 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.19 
 
 		 520 aa  882    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  58.32 
 
 		 528 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  58.32 
 
 		 528 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.32 
 
 		 528 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  58.51 
 
 		 528 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  58.51 
 
 		 528 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.51 
 
 		 527 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.32 
 
 		 528 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.93 
 
 		 523 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.93 
 
 		 523 aa  592  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  58.51 
 
 		 528 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.32 
 
 		 528 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.51 
 
 		 528 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  58.32 
 
 		 528 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.32 
 
 		 528 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  58.32 
 
 		 528 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.51 
 
 		 527 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.75 
 
 		 531 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.94 
 
 		 531 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.55 
 
 		 531 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3274  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.55 
 
 		 531 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.028442  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.75 
 
 		 523 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.95 
 
 		 530 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.13 
 
 		 515 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  53.21 
 
 		 512 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  52.81 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  52.81 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  53.01 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.32 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  52.32 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  52.32 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.17 
 
 		 510 aa  549  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.81 
 
 		 511 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.13 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  53.82 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.82 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  53.82 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.82 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  53.82 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  53.82 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  53.82 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.82 
 
 		 513 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  53.82 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.01 
 
 		 511 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  52.62 
 
 		 518 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  52.81 
 
 		 512 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.66 
 
 		 544 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  53.29 
 
 		 515 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.76 
 
 		 518 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.45 
 
 		 520 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.22 
 
 		 518 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.64 
 
 		 537 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.08 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 		 519 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.18 
 
 		 522 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.7 
 
 		 519 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.7 
 
 		 519 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.7 
 
 		 519 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.6 
 
 		 519 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 		 519 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 		 519 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.7 
 
 		 519 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 		 519 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 		 519 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.6 
 
 		 519 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.6 
 
 		 519 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.79 
 
 		 524 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  48.79 
 
 		 520 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.5 
 
 		 519 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.77 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 		 519 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.77 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3598  multidrug resistance protein Y  46.77 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0257273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 		 515 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.2 
 
 		 527 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  46.77 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  46.77 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  46.77 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.3 
 
 		 519 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48 
 
 		 521 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02277  predicted multidrug efflux system  46.97 
 
 		 512 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866508  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2504  multidrug resistance protein Y  46.97 
 
 		 512 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0957152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02238  hypothetical protein  46.97 
 
 		 512 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.945599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.01 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.83 
 
 		 577 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>