More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3598 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02277  predicted multidrug efflux system  99.02 
 
 
512 aa  1015    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866508  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  99.22 
 
 
512 aa  1014    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  63 
 
 
512 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  63.2 
 
 
512 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  62.53 
 
 
511 aa  648    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  63.05 
 
 
511 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  99.22 
 
 
512 aa  1014    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2504  multidrug resistance protein Y  98.83 
 
 
512 aa  1013    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0957152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  62.53 
 
 
511 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02238  hypothetical protein  99.02 
 
 
512 aa  1015    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.945599  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.22 
 
 
512 aa  1014    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.8 
 
 
515 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  99.02 
 
 
512 aa  1013    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  63.2 
 
 
512 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.53 
 
 
511 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3598  multidrug resistance protein Y  100 
 
 
512 aa  1024    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0257273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  63 
 
 
512 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  62.25 
 
 
511 aa  647    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  99.22 
 
 
512 aa  1014    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  62.58 
 
 
512 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  62.58 
 
 
512 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  62.58 
 
 
512 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  62.58 
 
 
512 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62.58 
 
 
512 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  62.58 
 
 
512 aa  625  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  62.78 
 
 
512 aa  626  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  62.58 
 
 
512 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.12 
 
 
511 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  62.6 
 
 
512 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.08 
 
 
510 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  61.8 
 
 
515 aa  608  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.16 
 
 
513 aa  608  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.54 
 
 
520 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.01 
 
 
520 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  46.81 
 
 
520 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.96 
 
 
520 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.77 
 
 
520 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.96 
 
 
520 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.35 
 
 
520 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.77 
 
 
520 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.76 
 
 
520 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.35 
 
 
520 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.35 
 
 
520 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.77 
 
 
520 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.76 
 
 
520 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.76 
 
 
520 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.99 
 
 
520 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.01 
 
 
519 aa  485  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.01 
 
 
519 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.01 
 
 
519 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.81 
 
 
519 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.42 
 
 
519 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.42 
 
 
519 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.42 
 
 
519 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.22 
 
 
519 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.42 
 
 
519 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.42 
 
 
519 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.42 
 
 
519 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.42 
 
 
519 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.61 
 
 
519 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  47.07 
 
 
518 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49 
 
 
520 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.41 
 
 
519 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.41 
 
 
519 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.87 
 
 
544 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.28 
 
 
511 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.86 
 
 
520 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.37 
 
 
537 aa  458  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.36 
 
 
511 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.06 
 
 
521 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.88 
 
 
524 aa  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.43 
 
 
520 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.08 
 
 
511 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.34 
 
 
509 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.01 
 
 
520 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.28 
 
 
511 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.87 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  44.87 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.87 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  44.87 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  44.87 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.2 
 
 
515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.58 
 
 
518 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  44.87 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.87 
 
 
528 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.87 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.58 
 
 
518 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.67 
 
 
527 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.2 
 
 
520 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.89 
 
 
533 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  44.67 
 
 
528 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  44.67 
 
 
528 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.86 
 
 
521 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.67 
 
 
528 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.98 
 
 
523 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.98 
 
 
523 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.38 
 
 
522 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  45.13 
 
 
519 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  44.67 
 
 
528 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.67 
 
 
527 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>