More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5188 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  82.84 
 
 		 528 aa  846    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.84 
 
 		 528 aa  846    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  82.84 
 
 		 528 aa  847    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  82.84 
 
 		 528 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.84 
 
 		 528 aa  847    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  82.84 
 
 		 528 aa  846    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  98.31 
 
 		 531 aa  1030    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  82.84 
 
 		 528 aa  847    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.1 
 
 		 523 aa  852    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.1 
 
 		 523 aa  852    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  82.84 
 
 		 528 aa  846    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  82.84 
 
 		 528 aa  846    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.84 
 
 		 528 aa  846    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 531 aa  1049    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3274  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.44 
 
 		 531 aa  1042    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.028442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.84 
 
 		 527 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.84 
 
 		 527 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.84 
 
 		 528 aa  847    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.44 
 
 		 531 aa  1042    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  93.03 
 
 		 523 aa  967    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  96.22 
 
 		 530 aa  966    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  82.84 
 
 		 528 aa  846    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.88 
 
 		 520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.49 
 
 		 520 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.68 
 
 		 520 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.29 
 
 		 520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.49 
 
 		 520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.68 
 
 		 520 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.68 
 
 		 520 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.05 
 
 		 520 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.05 
 
 		 520 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.59 
 
 		 520 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.86 
 
 		 520 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  56.75 
 
 		 520 aa  569  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.66 
 
 		 520 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.06 
 
 		 520 aa  568  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.66 
 
 		 520 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.98 
 
 		 511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  46.39 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.44 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.39 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  46.39 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.38 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  46.44 
 
 		 518 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.58 
 
 		 511 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  45.36 
 
 		 512 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.87 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  45.56 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.56 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  45.56 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  45.56 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  45.36 
 
 		 512 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  45.16 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  45.56 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.56 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  45.56 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  45.56 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  45.16 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.17 
 
 		 544 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.96 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  45.16 
 
 		 512 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.83 
 
 		 520 aa  438  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  45.09 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.56 
 
 		 518 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.66 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  43.46 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3598  multidrug resistance protein Y  43.86 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0257273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  43.66 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.66 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.28 
 
 		 518 aa  432  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  43.66 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.16 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.4 
 
 		 533 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.87 
 
 		 527 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.85 
 
 		 522 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02277  predicted multidrug efflux system  43.86 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866508  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.82 
 
 		 522 aa  425  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02238  hypothetical protein  43.86 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.945599  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.48 
 
 		 521 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.1 
 
 		 537 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.27 
 
 		 518 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.3 
 
 		 522 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2504  multidrug resistance protein Y  43.66 
 
 		 512 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0957152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  46.63 
 
 		 509 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.86 
 
 		 519 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.09 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.07 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68140  drug efflux transporter  46.22 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000279343  decreased coverage  0.00567017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.34 
 
 		 520 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  44.38 
 
 		 519 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.98 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.98 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.98 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.11 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.31 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1875  multidrug resistance protein B  59.14 
 
 		 360 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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