More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0450 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  100 
 
 		 424 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  92.69 
 
 		 420 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  90.38 
 
 		 423 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  90.38 
 
 		 423 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  86.45 
 
 		 439 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  90.61 
 
 		 422 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  85.47 
 
 		 459 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  64.61 
 
 		 430 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 408 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 410 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  32.23 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.97 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.96 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 402 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 442 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  28.35 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 427 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  28.89 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.37 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.37 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  24.31 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 415 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.77 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 427 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.6 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 402 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  25.78 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  26.79 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.07 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  26.68 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  25.78 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  25.81 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  29.32 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.07 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 422 aa  99.8  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 409 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 422 aa  99.8  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  25.78 
 
 		 402 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 420 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  25.67 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 421 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  25.83 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  26.97 
 
 		 510 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 417 aa  97.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  26.9 
 
 		 435 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 457 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 442 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.65 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 409 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 400 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.08 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 441 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  25.29 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>