40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66842 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_66842  Monocarboxylate transporter  100 
 
 
523 aa  1063    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.756809  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_4422  Monocarboxylate transporter  75.85 
 
 
410 aa  622  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32560  Monocarboxylate transporter  41.35 
 
 
512 aa  341  2e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03658  MFS transporter (Mch2), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12260)  27.99 
 
 
485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0976864  normal  0.916138 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  28.06 
 
 
606 aa  186  6e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08507  conserved hypothetical protein  25.22 
 
 
442 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000272571  normal  0.0467557 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  22.9 
 
 
448 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  24.4 
 
 
471 aa  88.2  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  23.26 
 
 
436 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08366  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 
443 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.469129 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  22.77 
 
 
506 aa  86.7  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  23.76 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03722  MFS monocarboxylate transporter (Mct), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17360)  22.81 
 
 
482 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  23.32 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  23.56 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00528  conserved hypothetical protein  23.4 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10410  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05660)  24.85 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07898  conserved hypothetical protein  22.74 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189229 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33613  Monocarboxylate transporter  24.38 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09333  Monocarboxylate transporter (Eurofung)  24.44 
 
 
1072 aa  67.8  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143082  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02840  Monocarboxylate transporter-like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I2]  23 
 
 
445 aa  67  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00450414 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03997  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03240)  20 
 
 
437 aa  63.9  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00242974  normal  0.101334 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00382  conserved hypothetical protein  24.16 
 
 
431 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483228  normal  0.39904 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  23.1 
 
 
432 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02430  transporter, putative  22.9 
 
 
453 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  22.61 
 
 
421 aa  61.2  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30340  monocarboxylate permease homolog  25.66 
 
 
454 aa  61.2  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.22847  normal  0.486952 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11092  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00780)  23.3 
 
 
429 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08995  conserved hypothetical protein  21.95 
 
 
358 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.343646  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03970  transporter, putative  21.76 
 
 
539 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  21.29 
 
 
439 aa  57.4  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04790  transporter, putative  23.56 
 
 
449 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04160  transporter, putative  25.66 
 
 
360 aa  54.7  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04810  transporter, putative  23.77 
 
 
448 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08934  conserved hypothetical protein  20.57 
 
 
432 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279116  normal  0.171423 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  21 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00830  monocarboxylic acid transporter, putative  22.44 
 
 
428 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  21.28 
 
 
418 aa  48.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04800  monocarboxylic acid transporter, putative  23.11 
 
 
447 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
413 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>