163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30034 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  100 
 
 		 471 aa  941    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33613  Monocarboxylate transporter  46.65 
 
 		 453 aa  408  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30340  monocarboxylate permease homolog  47.09 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.22847  normal  0.486952 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  40.32 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  36.54 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  36.47 
 
 		 421 aa  249  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  32.9 
 
 		 448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02840  Monocarboxylate transporter-like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I2]  30.98 
 
 		 445 aa  223  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00450414 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  34.16 
 
 		 432 aa  210  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03722  MFS monocarboxylate transporter (Mct), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17360)  30.94 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  29.68 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09333  Monocarboxylate transporter (Eurofung)  27.37 
 
 		 1072 aa  173  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143082  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  29.35 
 
 		 487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02430  transporter, putative  30.32 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  29.15 
 
 		 450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08507  conserved hypothetical protein  28.96 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000272571  normal  0.0467557 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03997  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03240)  28.51 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00242974  normal  0.101334 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00528  conserved hypothetical protein  25.49 
 
 		 428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08366  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 		 443 aa  133  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07898  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189229 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11092  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00780)  25.65 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03970  transporter, putative  24.64 
 
 		 539 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10410  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05660)  27.45 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  26.14 
 
 		 506 aa  109  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08934  conserved hypothetical protein  26.35 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279116  normal  0.171423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 430 aa  93.6  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66842  Monocarboxylate transporter  24.4 
 
 		 523 aa  88.2  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.756809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  25 
 
 		 606 aa  84.7  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03658  MFS transporter (Mch2), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12260)  24.72 
 
 		 485 aa  83.2  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0976864  normal  0.916138 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08995  conserved hypothetical protein  26.13 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.343646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04810  transporter, putative  24.31 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00830  monocarboxylic acid transporter, putative  21.97 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 422 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32560  Monocarboxylate transporter  23.33 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04780  transporter, putative  21.48 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_4422  Monocarboxylate transporter  25.89 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04800  monocarboxylic acid transporter, putative  21.89 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04160  transporter, putative  22.96 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  23.03 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  26.61 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  21.2 
 
 		 419 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 443 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  26.72 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  25.07 
 
 		 443 aa  53.5  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 405 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  22.82 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  23.03 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  23.03 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  23.03 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  22.58 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  30.67 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  30.67 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 453 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 		 405 aa  50.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  22.71 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  22.71 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  22.71 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  22.71 
 
 		 400 aa  50.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 453 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 453 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  30.67 
 
 		 453 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 453 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  22.71 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00382  conserved hypothetical protein  24.17 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483228  normal  0.39904 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.16 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>