More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4224 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  807    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  79.35 
 
 		 416 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  80.45 
 
 		 415 aa  607  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  79.85 
 
 		 414 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  68.13 
 
 		 412 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  63.45 
 
 		 411 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  60.65 
 
 		 409 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  58 
 
 		 414 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  57.29 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  55.96 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  49.74 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  50.5 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 409 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  30.17 
 
 		 410 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 404 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.12 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.95 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 457 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  26.7 
 
 		 430 aa  93.2  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 420 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  23.98 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  27.4 
 
 		 506 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  26.68 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.56 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  25.74 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  28.84 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  24.78 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.03 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  22.55 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  23.31 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  26.03 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33613  Monocarboxylate transporter  22.6 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.08 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  23.8 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  24.56 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  28.79 
 
 		 528 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  25.89 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04160  transporter, putative  27.25 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30340  monocarboxylate permease homolog  23.16 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.22847  normal  0.486952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  30.25 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  28.89 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  24.78 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>