More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2099 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  804    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  77.97 
 
 		 417 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  75 
 
 		 405 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  74.75 
 
 		 405 aa  608  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  77.39 
 
 		 413 aa  608  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  72.37 
 
 		 412 aa  600  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  72.86 
 
 		 407 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  69.42 
 
 		 407 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  72.95 
 
 		 430 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  70.2 
 
 		 414 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  69.35 
 
 		 408 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  59.75 
 
 		 403 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  60 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  58.06 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  53.08 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  54.06 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  54.1 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  53.44 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  53.33 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  54.5 
 
 		 402 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 410 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 408 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  51.37 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  53.32 
 
 		 402 aa  360  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  52.2 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  50.92 
 
 		 408 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  51.42 
 
 		 410 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  50.9 
 
 		 410 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  52.77 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 417 aa  349  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 410 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 410 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 410 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  53.13 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 410 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  49.61 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  52.64 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  51.89 
 
 		 399 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  45.5 
 
 		 414 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  50.9 
 
 		 405 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  45.62 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  50.9 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 436 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  41.75 
 
 		 412 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 433 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  41.07 
 
 		 404 aa  298  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  42.08 
 
 		 528 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  41.5 
 
 		 421 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 413 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  40 
 
 		 415 aa  275  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 		 411 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  42.41 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  42.08 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  42.08 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  42.08 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  42.08 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  42.08 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  42.08 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 414 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  40.15 
 
 		 411 aa  253  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  40.57 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 427 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 403 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  37.92 
 
 		 421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 411 aa  209  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 438 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 422 aa  142  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  29 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 452 aa  123  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.59 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.15 
 
 		 429 aa  119  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.15 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 433 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 472 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>