More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1761 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  768    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  79.55 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  80.6 
 
 		 402 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  80.35 
 
 		 402 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  81.25 
 
 		 402 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  79.55 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  79.35 
 
 		 406 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  80.86 
 
 		 402 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  80.3 
 
 		 400 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  80.61 
 
 		 399 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  78.93 
 
 		 399 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  60.15 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  55.47 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  59.9 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  55.7 
 
 		 407 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  55.64 
 
 		 403 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  54.23 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  59.07 
 
 		 410 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  55.53 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  53.13 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  53.5 
 
 		 410 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  54.7 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  54.17 
 
 		 412 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  55 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  51.77 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  54.99 
 
 		 408 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  51.66 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  51.66 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  55.12 
 
 		 405 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  55.3 
 
 		 430 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 406 aa  359  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  47.77 
 
 		 404 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 404 aa  345  7e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  46.36 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  47.21 
 
 		 414 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  50 
 
 		 410 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  48.38 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  46.38 
 
 		 436 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  49.24 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  48.16 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  48.38 
 
 		 410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 417 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 412 aa  322  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  45.71 
 
 		 528 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  47.01 
 
 		 409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  50.77 
 
 		 405 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  49.49 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 		 409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  42.46 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  44.17 
 
 		 416 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  46.19 
 
 		 398 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  46.19 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  46.19 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  46.19 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  46.19 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  46.19 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  46.19 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 416 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 411 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 411 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 414 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 412 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 412 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 411 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  40.2 
 
 		 411 aa  259  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 415 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  40.46 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 427 aa  226  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  39.52 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 442 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  30.85 
 
 		 452 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 433 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  29.74 
 
 		 435 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  30.43 
 
 		 425 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.73 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>