More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1328 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  784    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  97.78 
 
 		 405 aa  675    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  63.48 
 
 		 410 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  64.74 
 
 		 410 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  63.73 
 
 		 410 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  63.73 
 
 		 410 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  63.22 
 
 		 410 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  63 
 
 		 410 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  62.25 
 
 		 410 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  63.8 
 
 		 480 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  52.3 
 
 		 407 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  49.11 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  51.81 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  47.28 
 
 		 413 aa  355  5.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  53.11 
 
 		 402 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  52.59 
 
 		 400 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  52.01 
 
 		 402 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  46.55 
 
 		 412 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 410 aa  354  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  47.06 
 
 		 405 aa  352  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 		 405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  49.37 
 
 		 405 aa  352  8.999999999999999e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  47.54 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  52.07 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  50.62 
 
 		 402 aa  350  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  46.42 
 
 		 412 aa  346  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 406 aa  345  7e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  48.95 
 
 		 408 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  51.61 
 
 		 400 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 404 aa  342  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  51.39 
 
 		 408 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  51.93 
 
 		 399 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  52.57 
 
 		 410 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 404 aa  335  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  51.9 
 
 		 408 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  47.55 
 
 		 430 aa  334  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  51.81 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  50.39 
 
 		 399 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  43.57 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 412 aa  328  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  43 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  49.61 
 
 		 528 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  47.19 
 
 		 416 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 401 aa  315  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 436 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 409 aa  308  8e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  49.24 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  49.24 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  49.24 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  49.24 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  49.24 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  49.24 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 		 409 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  49.87 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 412 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 413 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  48.26 
 
 		 414 aa  292  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 411 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  41.15 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 414 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  40.15 
 
 		 411 aa  259  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 405 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  38.5 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  38.67 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 422 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  29.87 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.24 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.33 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4365  hypothetical protein  61.54 
 
 		 126 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 409 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>