More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2977 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 412 aa  784    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  92.86 
 
 		 415 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  88.09 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  71.32 
 
 		 421 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 405 aa  342  5.999999999999999e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  48.21 
 
 		 403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  43.37 
 
 		 528 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  41.54 
 
 		 414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 405 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 416 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  41.59 
 
 		 402 aa  260  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  39.9 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  43.12 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  43.12 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  43.12 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  43.12 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  43.12 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  43.12 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  43.12 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  39.22 
 
 		 407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 408 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  40.45 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 402 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 414 aa  243  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  37.68 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 412 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  39.95 
 
 		 402 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 400 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  41.15 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 410 aa  233  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  38.78 
 
 		 430 aa  232  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  43.04 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  41.65 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 408 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 402 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  37.94 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  40.97 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  34.84 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 411 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 410 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 		 411 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 410 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 410 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 401 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  39.51 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 433 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 412 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  34.45 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 412 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 414 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 411 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  34.21 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 		 409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 		 433 aa  146  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  29.32 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.53 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 431 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.45 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>