More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0927 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  83.91 
 
 
412 aa  671    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  99.75 
 
 
405 aa  795    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
405 aa  796    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  75.68 
 
 
417 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  78.28 
 
 
413 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  74.75 
 
 
406 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  73.62 
 
 
408 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  77.61 
 
 
430 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  71.11 
 
 
407 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  70.2 
 
 
407 aa  549  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  68.96 
 
 
414 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  60.35 
 
 
403 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  60.2 
 
 
425 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  59.46 
 
 
410 aa  459  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  53.16 
 
 
400 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  51.29 
 
 
402 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  53.67 
 
 
400 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  52.67 
 
 
402 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  52.67 
 
 
402 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  53.05 
 
 
406 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  54.26 
 
 
402 aa  352  8.999999999999999e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  54.78 
 
 
399 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  53.44 
 
 
402 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  45.01 
 
 
414 aa  346  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  44.83 
 
 
417 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  47.55 
 
 
410 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  53.75 
 
 
399 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  47.81 
 
 
405 aa  342  8e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  47.46 
 
 
412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 
408 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  52.23 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  42.79 
 
 
406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  48.88 
 
 
410 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  48.58 
 
 
410 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  48.32 
 
 
410 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  48.32 
 
 
410 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  48.13 
 
 
410 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  48.69 
 
 
408 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  47.55 
 
 
410 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  48.07 
 
 
410 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  45.69 
 
 
480 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  51.66 
 
 
401 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  46.39 
 
 
412 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  43.8 
 
 
436 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 
405 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  44.64 
 
 
409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  44.64 
 
 
409 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  39.64 
 
 
404 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  40.85 
 
 
404 aa  298  8e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  40.45 
 
 
411 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  41.5 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  40.53 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  38.87 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  40.26 
 
 
411 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  39.8 
 
 
433 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  41.09 
 
 
528 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  42.04 
 
 
398 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  41.86 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  41.86 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  41.86 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  41.86 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  41.86 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  41.86 
 
 
417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  38.42 
 
 
412 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  40.4 
 
 
416 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 
416 aa  269  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  38.42 
 
 
412 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  37.53 
 
 
421 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  39.81 
 
 
414 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  37.87 
 
 
405 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  37.92 
 
 
415 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  38.5 
 
 
412 aa  259  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  39.74 
 
 
414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  37.94 
 
 
415 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  37.59 
 
 
411 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  34.73 
 
 
403 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  36.76 
 
 
412 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  36.97 
 
 
427 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  37.53 
 
 
389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  35.17 
 
 
411 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  37.47 
 
 
421 aa  203  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  33.07 
 
 
422 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
452 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
433 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
438 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  28.61 
 
 
452 aa  137  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  28.84 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  27.87 
 
 
428 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.93 
 
 
435 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  28.61 
 
 
414 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  29.72 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  28.19 
 
 
427 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  30.43 
 
 
425 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  27.92 
 
 
442 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  28.34 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>