More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3109 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  803    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  77.27 
 
 		 416 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  77.51 
 
 		 416 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  74.81 
 
 		 528 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  73.32 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  73.32 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  73.32 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  73.32 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  73.32 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  73.32 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  73.92 
 
 		 398 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  45.07 
 
 		 411 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 410 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  45.6 
 
 		 413 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  48.7 
 
 		 400 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 402 aa  309  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 410 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  47.67 
 
 		 402 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 410 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 410 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 402 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  48.31 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 403 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  47.41 
 
 		 402 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 410 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 404 aa  295  9e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  48.57 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  44.28 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  47.47 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  43.05 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 414 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  47.72 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  41.46 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  40.69 
 
 		 414 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 409 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 409 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  41.54 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  48.25 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  44.28 
 
 		 480 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 406 aa  279  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  47.26 
 
 		 405 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  40.4 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  47.52 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  40 
 
 		 417 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  39.29 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  38.18 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  38.1 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 405 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 		 407 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  40.25 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  42.17 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 408 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  37.81 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  40.9 
 
 		 421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 415 aa  240  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 427 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  38.15 
 
 		 411 aa  233  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 411 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 442 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  31.93 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  32.18 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 452 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>