More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3111 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  92.39 
 
 		 410 aa  646    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  768    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  98.53 
 
 		 408 aa  753    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  61.81 
 
 		 400 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  60.76 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  62.92 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  60.8 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  60 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  63.38 
 
 		 400 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  61.06 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  60.61 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  60.15 
 
 		 401 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  62.92 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  61.95 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  50.38 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  51.39 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  51.62 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  48.49 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  52.13 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  50 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 		 405 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  48.12 
 
 		 413 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  48.97 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 408 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  51.03 
 
 		 430 aa  345  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  47.47 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  50.9 
 
 		 410 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  48.85 
 
 		 417 aa  339  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  46.87 
 
 		 414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  48.06 
 
 		 407 aa  334  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  45.55 
 
 		 404 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  50.65 
 
 		 410 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  50.65 
 
 		 410 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 410 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  47 
 
 		 480 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  46.38 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 412 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  51.26 
 
 		 405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 409 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 		 409 aa  300  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  47.78 
 
 		 528 aa  299  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 413 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  46.12 
 
 		 417 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  46.12 
 
 		 417 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  46.12 
 
 		 417 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  46.12 
 
 		 417 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  46.12 
 
 		 417 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  46.12 
 
 		 417 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 411 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 411 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  47.01 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  40.95 
 
 		 411 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 414 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  40 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 412 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 412 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 415 aa  248  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  38.63 
 
 		 414 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  39.2 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 415 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  41.51 
 
 		 412 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 403 aa  216  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  40.16 
 
 		 421 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 433 aa  133  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  28.99 
 
 		 452 aa  123  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  29.98 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.53 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.53 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>