More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1339 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 412 aa  806    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  84.16 
 
 		 405 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  78.41 
 
 		 417 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  84.16 
 
 		 405 aa  677    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  77.86 
 
 		 413 aa  618  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  73.11 
 
 		 406 aa  609  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  77.92 
 
 		 430 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  73.07 
 
 		 408 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  71.46 
 
 		 407 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  72.18 
 
 		 407 aa  567  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  67.8 
 
 		 414 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  60 
 
 		 403 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  59.85 
 
 		 425 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  57.88 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  51.02 
 
 		 402 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  52.69 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  51.62 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  52.42 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  54.14 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  52.69 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  52.17 
 
 		 406 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  53.96 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  50.89 
 
 		 408 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 410 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  53.13 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  52.23 
 
 		 400 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  44.91 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  47.7 
 
 		 412 aa  346  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  48.88 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  45.41 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  52.01 
 
 		 399 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  49.61 
 
 		 410 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  47.13 
 
 		 480 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  49.35 
 
 		 410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  53.16 
 
 		 401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  49.35 
 
 		 410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 410 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  50.52 
 
 		 410 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 412 aa  332  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  48.71 
 
 		 410 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  46.55 
 
 		 405 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  40.16 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 404 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  44.25 
 
 		 409 aa  299  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  41.71 
 
 		 528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 412 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 412 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  40.9 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 411 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 411 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  38.57 
 
 		 421 aa  275  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  41.67 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  41.67 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  41.67 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  42.45 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  41.67 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  41.67 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  41.67 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 415 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 412 aa  265  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 414 aa  262  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  41.64 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  38.86 
 
 		 412 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  36.27 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  39.58 
 
 		 421 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  30.34 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 438 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  28.57 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.57 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  30.25 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  31.59 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 457 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>