283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1682 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  799    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  68.81 
 
 		 389 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  50.92 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  49.25 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  49.25 
 
 		 411 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 408 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  35.52 
 
 		 412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 		 408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  36.83 
 
 		 528 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 417 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 406 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 408 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 416 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  36.48 
 
 		 407 aa  226  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  35.17 
 
 		 405 aa  226  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  35.68 
 
 		 413 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  35.17 
 
 		 405 aa  225  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  38.71 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  36.05 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  37.53 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  35.15 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  36.9 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  36.9 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  36.9 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  36.9 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  36.9 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  36.9 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 412 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 404 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  37.33 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 410 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 		 407 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 412 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  35.18 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  33.82 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 409 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  37.06 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  36.29 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  32.71 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  36.7 
 
 		 399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 412 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  34.61 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  35.66 
 
 		 412 aa  186  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  32.17 
 
 		 421 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  26.18 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.49 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  26.42 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  26.42 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 422 aa  97.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 435 aa  87  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>