More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3859 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  783    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  72.24 
 
 		 411 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  71.46 
 
 		 410 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  73.28 
 
 		 408 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  72.86 
 
 		 409 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  73.83 
 
 		 405 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  71.5 
 
 		 411 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  71.5 
 
 		 411 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  70.65 
 
 		 402 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  73.07 
 
 		 410 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  58.08 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  56.03 
 
 		 413 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  55.36 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  56.89 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 411 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  27.54 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  29 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  29.35 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 430 aa  106  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  30.1 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  28.62 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.41 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.32 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  27.91 
 
 		 528 aa  99.8  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 420 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 430 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  28.23 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  28.23 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  28.23 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  28.23 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  28.23 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  28.23 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  28.23 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 434 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 408 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.84 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 431 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.72 
 
 		 423 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 423 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.72 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 427 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.86 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  27 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.86 
 
 		 435 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 433 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 421 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 428 aa  89.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 421 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  24.06 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  25.54 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.02 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 412 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 452 aa  86.7  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 427 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  27.3 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>