255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2280 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
405 aa  778    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  72.33 
 
 
416 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  56.28 
 
 
419 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  50.27 
 
 
416 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  50.27 
 
 
416 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  50.81 
 
 
395 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  50 
 
 
401 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  45.43 
 
 
403 aa  273  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  48.81 
 
 
409 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  46.61 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  33.95 
 
 
417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  34.02 
 
 
425 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
410 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 
408 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
415 aa  163  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  33.42 
 
 
442 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  33.16 
 
 
408 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
433 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
414 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  30.81 
 
 
410 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  31.65 
 
 
414 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  33.33 
 
 
387 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  31.37 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  33.24 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
426 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  32.21 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 
391 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  32.76 
 
 
387 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  31.01 
 
 
415 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  31.59 
 
 
402 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
402 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  31 
 
 
402 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  28.36 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  29.09 
 
 
408 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  31.83 
 
 
387 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  28.87 
 
 
411 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  27.84 
 
 
402 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 
400 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
397 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
411 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  27.55 
 
 
393 aa  103  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  27.07 
 
 
369 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 
404 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  29.89 
 
 
411 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  29.89 
 
 
411 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  28.38 
 
 
402 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  29.61 
 
 
411 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  29.95 
 
 
408 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  30.79 
 
 
397 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  37.37 
 
 
216 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  28.45 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  29.21 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  29.36 
 
 
395 aa  97.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  27.83 
 
 
403 aa  97.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.86 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  31.94 
 
 
405 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
408 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  31.3 
 
 
409 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  25.27 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.61 
 
 
410 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
402 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  28.07 
 
 
399 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
400 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  27.7 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  26.12 
 
 
410 aa  87  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  35.88 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  30.64 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  29.86 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  27.86 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  25.99 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  27.57 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  28.33 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.56 
 
 
434 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  24.24 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  28.57 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  23.35 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  28.17 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  23.21 
 
 
412 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
430 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
421 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  25.45 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  32.09 
 
 
417 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  23.31 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  24.39 
 
 
408 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25 
 
 
426 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  25.32 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  25.56 
 
 
417 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.16 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.09 
 
 
459 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
411 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  22.39 
 
 
427 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.627117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>