More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5285 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  89.95 
 
 
411 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  100 
 
 
408 aa  788    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  86.76 
 
 
405 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  90.44 
 
 
411 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  83.41 
 
 
410 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  86.06 
 
 
409 aa  660    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  90.44 
 
 
411 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  73.95 
 
 
402 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  72.11 
 
 
410 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  67.73 
 
 
402 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  58.31 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  56.04 
 
 
413 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  55.14 
 
 
404 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  56.14 
 
 
404 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
417 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
419 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  29.22 
 
 
414 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  28.39 
 
 
412 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  28.88 
 
 
416 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  28.46 
 
 
411 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 
408 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
430 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  27.53 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
414 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  29.07 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  29.56 
 
 
434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
409 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  27.74 
 
 
407 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.37 
 
 
420 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  29.85 
 
 
411 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
411 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.89 
 
 
459 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  29.77 
 
 
423 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  29.77 
 
 
423 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
411 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.02 
 
 
410 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  28.4 
 
 
413 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  31.13 
 
 
414 aa  99.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  28.46 
 
 
402 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  29.32 
 
 
422 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.95 
 
 
439 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27.49 
 
 
424 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 
405 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  28.38 
 
 
528 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.11 
 
 
452 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  23.56 
 
 
412 aa  90.5  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  27.48 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.62 
 
 
412 aa  90.1  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  25.81 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.08 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  25.9 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  27.14 
 
 
418 aa  86.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  26.76 
 
 
425 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  28.57 
 
 
480 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.53 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  29.58 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  25.99 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.34 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  24.3 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
434 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.63 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  30.55 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  26.56 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  26.56 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 
421 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  26.56 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  26.84 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  26.56 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  26.56 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  26.56 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  27.56 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  25.82 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.45 
 
 
408 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  27.32 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  27.55 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  25.47 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  28.94 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  27.72 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  25.26 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  25.51 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  26.35 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  26.93 
 
 
435 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.72 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  25.37 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25.45 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  25.9 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>