More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0983 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 410 aa  801    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  73.18 
 
 		 402 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  71.11 
 
 		 411 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  72.11 
 
 		 408 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  70.32 
 
 		 410 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  70.78 
 
 		 411 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  70 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  70.78 
 
 		 411 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  69.58 
 
 		 405 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  68.27 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  56.92 
 
 		 413 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  55.84 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  53.81 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  55.44 
 
 		 404 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  30.03 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 394 aa  136  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  29.25 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.47 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  28.95 
 
 		 425 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 411 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.76 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 423 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 442 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.35 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 411 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 410 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  28.3 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 427 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 430 aa  98.2  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  23.34 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  29 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  28.07 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  28.07 
 
 		 398 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  26.46 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.86 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  22.72 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 434 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  26.5 
 
 		 404 aa  90.1  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 427 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  27.74 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 421 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.74 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>