More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1829 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  83.38 
 
 		 416 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  806    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  84.17 
 
 		 415 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  79.13 
 
 		 411 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  71.5 
 
 		 412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  65.1 
 
 		 411 aa  484  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  59.3 
 
 		 409 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  59.9 
 
 		 414 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  52.62 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  51.21 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  54.96 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  53.92 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  50.88 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 402 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  33.23 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  29.95 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 411 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.34 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  26.22 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.91 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  28.09 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  25.82 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.7 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  23.1 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  27.18 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30340  monocarboxylate permease homolog  23.45 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.22847  normal  0.486952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  23.85 
 
 		 506 aa  67  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  27.27 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  27.27 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  21.7 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  24.78 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  27.34 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  24.83 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  27.36 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33613  Monocarboxylate transporter  21.19 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>