162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5287 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  780    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  79.7 
 
 		 405 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  79.21 
 
 		 404 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8475  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 446 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.746267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 427 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.3 
 
 		 434 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  22.6 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  30.25 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  21.17 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  22.33 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0267  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  25.21 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  25.07 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02840  Monocarboxylate transporter-like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I2]  30.49 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00450414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  28 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  24.15 
 
 		 412 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  27.12 
 
 		 510 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 403 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07898  conserved hypothetical protein  28.62 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  26.22 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5076  major facilitator superfamily permease protein  24.36 
 
 		 512 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  27.57 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3759  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  24.2 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  26.12 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  25.7 
 
 		 432 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  20.67 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08366  conserved hypothetical protein  27.9 
 
 		 443 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 422 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>