154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3395 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  779    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  61.94 
 
 		 414 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  57.36 
 
 		 409 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 412 aa  286  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 412 aa  263  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  40.48 
 
 		 401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4200  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 416 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  35.79 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5070  Major facilitator superfamily permease protein  34.75 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 411 aa  196  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2183  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362785  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0334  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00118696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  21.52 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.19 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  27.84 
 
 		 415 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  22.33 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  23.18 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  28.85 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.19 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  22.49 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  22.49 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  22.49 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 459 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1540  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  22.51 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.91 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  24.91 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  22.51 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  22.14 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  22.51 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  22.14 
 
 		 449 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  22.51 
 
 		 449 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  22.14 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  25.92 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  24.91 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  24.16 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  22.14 
 
 		 449 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  21.64 
 
 		 184 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.91 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.91 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.91 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.91 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.54 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  20.55 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.54 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.54 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.54 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  22.14 
 
 		 449 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 403 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.54 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.54 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.54 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.56 
 
 		 449 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3717  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  25.26 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  28.33 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 		 421 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>