37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2183 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2183  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  759    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362785  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  39.5 
 
 		 411 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  37 
 
 		 414 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0334  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00118696  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5070  Major facilitator superfamily permease protein  34.57 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 402 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4200  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  32.95 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 442 aa  106  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  26.07 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2761  General substrate transporter  28.57 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 430 aa  49.7  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6136  general substrate transporter  29.82 
 
 		 477 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0958  major facilitator superfamily citrate/H(+) symporter  30.77 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646724  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  30.81 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  30.81 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  27.43 
 
 		 437 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>