40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0334 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0334  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  754    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00118696  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  36.86 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2183  major facilitator transporter  48.11 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362785  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 409 aa  232  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5070  Major facilitator superfamily permease protein  36.96 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4200  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 416 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279328  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.93 
 
 		 401 aa  180  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  24.54 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  20.77 
 
 		 486 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 390 aa  53.1  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  26.64 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  21.4 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  21.4 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  23.3 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 437 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  26.89 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  26.09 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 423 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 443 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>