176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1427 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  807    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 414 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 486 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 420 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 449 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 401 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 434 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  28.95 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  29.12 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 437 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 416 aa  93.2  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  28.27 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5218  Permeases of the major facilitator superfamily  28.53 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  25.52 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  30.16 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  24.39 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  30 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.08 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  26.2 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  26.81 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  26.84 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  25.09 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.25 
 
 		 434 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 431 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 407 aa  57  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  23.73 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  26.35 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  27.05 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 409 aa  53.9  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  29.78 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 438 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  25.07 
 
 		 528 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.81 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.57 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 432 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 439 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  27.62 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  23.61 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.88 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>