53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5218 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5218  Permeases of the major facilitator superfamily  100 
 
 		 496 aa  956    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5076  major facilitator superfamily permease protein  48.88 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 414 aa  93.2  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  31.28 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  23.6 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 427 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 405 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 		 415 aa  47.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  22.6 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  23.65 
 
 		 407 aa  47  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  23.36 
 
 		 440 aa  47  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  20.68 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 398 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 405 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  24.91 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 417 aa  43.9  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 414 aa  43.5  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 417 aa  43.5  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 399 aa  43.5  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 414 aa  43.5  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  33.72 
 
 		 427 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 409 aa  43.1  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>