172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4759 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  858    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4200  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 416 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279328  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 486 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  24.55 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.66 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  27.99 
 
 		 401 aa  83.2  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  28.75 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  28.75 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  28.13 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  26.27 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.36 
 
 		 429 aa  67  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  26.25 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.27 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  29.09 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1540  major facilitator transporter  27 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5070  Major facilitator superfamily permease protein  26.23 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  26.55 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  21.6 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.38 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 394 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 442 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 450 aa  54.3  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 456 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 420 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>