More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0706 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  100 
 
 		 428 aa  836    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  64.07 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  64.48 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  62.16 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  62.47 
 
 		 410 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 394 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 368 aa  90.9  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  29.89 
 
 		 395 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 433 aa  86.7  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 428 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  27.68 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.41 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  28.64 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  25.87 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  26.84 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0393  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.464327  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1033  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2715  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2373  MFS family transporter  29.5 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.098036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  25.95 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  27.14 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  25.24 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  27.6 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 442 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.6 
 
 		 448 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  27.15 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  26.54 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  24.46 
 
 		 463 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  24.46 
 
 		 463 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  22.78 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2910  tartrate transporter, putative  24.1 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  29.43 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  24.46 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  24.46 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.25 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  24.46 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0235  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3879  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  23.74 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  23.5 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  24.02 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>