124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1534 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1534  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  818    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861998  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  61.94 
 
 		 409 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3395  major facilitator transporter  61.94 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0119  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 412 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0930  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 412 aa  262  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.218568  normal  0.0396235 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4200  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.279328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3442  major facilitator superfamily (MFS) transporter  40.16 
 
 		 401 aa  239  9e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2675  initiation factor 2  33.41 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5070  Major facilitator superfamily permease protein  36.48 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1523  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00662102  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0334  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00118696  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2183  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362785  normal  0.176029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  22.72 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  24.13 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  22.39 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  27.27 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  24.43 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  23.61 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  28.2 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 443 aa  49.7  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1320  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  hitchhiker  0.000000456317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  25.07 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  21.19 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 439 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  22.47 
 
 		 430 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.63 
 
 		 627 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3033  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.822126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 460 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 430 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.67 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.57 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 609 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  28 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2389  regulatory protein UhpC  25.12 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.365654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2433  regulatory protein UhpC  25.12 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.186527 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2437  regulatory protein UhpC  25.12 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2344  regulatory protein UhpC  25.12 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2547  regulatory protein UhpC  25.12 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  30.18 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  23 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  27.09 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  23.44 
 
 		 184 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  25.69 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  22.22 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>