More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7416 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  100 
 
 		 415 aa  819    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 441 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  30.43 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5529  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196316  hitchhiker  0.00000603603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 404 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.12 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.91 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 413 aa  97.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 428 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 402 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 414 aa  87.4  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  26 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 431 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  21.94 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  20.83 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  23.87 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  24.03 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  23.17 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  24 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  24.63 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  25.28 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  22.83 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  27.25 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  24.01 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  23.72 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  22.19 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  22.59 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  24.76 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  21.45 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  22.92 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>