More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3852 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  93.52 
 
 		 432 aa  760    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  858    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  858    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  71.6 
 
 		 427 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  72.38 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2939  transporter, putative  74.58 
 
 		 427 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  72.62 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1737  major facilitator transporter  74.1 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3171  major facilitator transporter  74.1 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3626  major facilitator transporter  74.34 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2806  transporter, putative  74.1 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3602  major facilitator transporter  74.1 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0029  major facilitator transporter  74.1 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3613  monocarboxylate MFS permease  74.1 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2897  major facilitator transporter  73.03 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.388241  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0473  major facilitator transporter  72.32 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.472982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0500  major facilitator transporter  72.32 
 
 		 427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0431  major facilitator transporter  72.08 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.592654  normal  0.379231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2605  major facilitator transporter  72.08 
 
 		 427 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0405  major facilitator transporter  72.08 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3588  major facilitator transporter  72.08 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.94844  normal  0.904194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  55.18 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3517  major facilitator transporter  55.37 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2300  major facilitator transporter  58.78 
 
 		 432 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  54.27 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0305  major facilitator superfamily MFS_1  61.17 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382232  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  49.52 
 
 		 430 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  52.43 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  53.52 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2533  major facilitator transporter  54.32 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  50 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  46.96 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  50.6 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1220  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.409801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  51.06 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  47.41 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  51.52 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  46.73 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  47.02 
 
 		 457 aa  355  8.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  48.04 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  46.98 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  48.78 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  48.68 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  48.58 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  48.19 
 
 		 442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  45.08 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  47.31 
 
 		 472 aa  332  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  45.67 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 422 aa  285  8e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3548  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 441 aa  282  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119426  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 		 424 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 		 409 aa  269  8.999999999999999e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 402 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 409 aa  136  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  27.64 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 409 aa  133  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  27.56 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  30.03 
 
 		 528 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  27.59 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.83 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  30 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 414 aa  118  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  28.46 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  30.73 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  30.73 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  30.73 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  30.73 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  30.73 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  30.73 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  30.7 
 
 		 402 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  26.55 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  30.49 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 408 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.6 
 
 		 434 aa  113  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>