More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2823 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  100 
 
 
408 aa  788    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 
415 aa  278  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 
422 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  36.11 
 
 
442 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
410 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  35.84 
 
 
410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  37.47 
 
 
415 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 
414 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  32.42 
 
 
417 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  32.03 
 
 
403 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  32.88 
 
 
395 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  33.88 
 
 
425 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  29.1 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  33.69 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  34.15 
 
 
416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  34.15 
 
 
416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  33.05 
 
 
432 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 
405 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
411 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  32.02 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 
402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 
419 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  31.37 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.6 
 
 
434 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  28.14 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  31.01 
 
 
402 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  31.98 
 
 
389 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  31.01 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  30.87 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  28.65 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  28.37 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  28.8 
 
 
399 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  27.99 
 
 
387 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  28.77 
 
 
397 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  29.66 
 
 
408 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
404 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  29.31 
 
 
422 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  26.95 
 
 
427 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  30.36 
 
 
387 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  29.62 
 
 
387 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  29.51 
 
 
387 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 
395 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  28.57 
 
 
425 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29 
 
 
428 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
399 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  27.49 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.58 
 
 
402 aa  94  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 
442 aa  94  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  28.11 
 
 
399 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  29.93 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  29.56 
 
 
393 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  27.27 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  25.29 
 
 
430 aa  90.5  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 
400 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 
404 aa  89.7  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  26.42 
 
 
434 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.43 
 
 
412 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  26.18 
 
 
500 aa  88.6  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  24.3 
 
 
400 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  28.43 
 
 
442 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  30.75 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  29.81 
 
 
404 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  25.29 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  26.98 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  25.71 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  25.23 
 
 
486 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.5 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  28.61 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
433 aa  84  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.98 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  30.96 
 
 
216 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  24.69 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.14 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
405 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  25.78 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  25.92 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  25.92 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  25.99 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.23 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  28.19 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  25.9 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  25.73 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
452 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  27.63 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>